Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms