Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms