Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms