Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U595 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Q3U595 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U595 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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