Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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