Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms