Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms