Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms