Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms