Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cul4aQ3TCH7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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