Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hddc2Q3SXD3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hddc2Q3SXD3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hddc2Q3SXD3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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