Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp8Q2V6D6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms