Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms