Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms