Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms