Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms