Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms