Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms