Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms