Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms