Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms