Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms