Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms