Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja5Q01231 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms