Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms