Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smn1P97801 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smn1P97801 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smn1P97801 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smn1P97801 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smn1P97801 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smn1P97801 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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