Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nbr1P97432 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nbr1P97432 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms