Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Irx2P81066 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irx2P81066 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irx2P81066 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irx2P81066 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irx2P81066 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irx2P81066 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms