Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms