Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms