Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rad54lP70270 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms