Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfixP70257 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfixP70257 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfixP70257 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfixP70257 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfixP70257 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfixP70257 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfixP70257 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfixP70257 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfixP70257 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfixP70257 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfixP70257 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfixP70257 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms