Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps11P62281 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms