Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Lmo4P61969 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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