Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl3P58873 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms