Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dpf3P58269 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dpf3P58269 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dpf3P58269 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dpf3P58269 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Dpf3P58269 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Dpf3P58269 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Dpf3P58269 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms