Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms