Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcstnP57716 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms