Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GferP56213 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms