Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rad23aP54726 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rad23aP54726 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms