Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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