Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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