Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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