Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc3P49135 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms