Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TgfaP48030 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms