Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms