Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NodalP43021 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NodalP43021 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NodalP43021 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NodalP43021 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NodalP43021 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms