Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms