Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms