Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
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